Mustafa Önsel, 1962 senesinde Zonguldak'ta doğmuştur.

1984 senesinde Kara Harp Okulu’nu bitiren Mardin, Şırnak, Hakkâri, Diyarbakır, Aydın, İstanbul, Foça gibi bölgelerde birlik komutanlığı yaptı. Bu süreçte yaklaşık 10 sene terörle mücadele etti. 

2002 senesinde mezun olduğu Kara Harp Akademisi'nden sonra 2006 senesine kadar Bursa Jandarma Bölge Komutanlığı’nda Kurmay Başkanı olarak görev yaptı. Sonra, atandığı Tokat'ta İl Jandarma Komutanı, Jandarma Genel Komutanlığı Teknik İstihbarat Daire Başkanı, Eğitim Daire Başkanı, üçüncü kez tutuklanmadan önce de kısa süreliğine Kurslar Komutanı olarak görev yaptı.

İlki 22 Şubat, İkincisi 5 Nisan 2010, Üçüncüsü ise 15 Şubat 2011'de olmak üzere kamuoyunda "Balyoz" diye bilinen dava kapsamında yaklaşık dört sene tutuklu kaldı. 19 Haziran 2014 tarihinde Anayasa Mahkemesinin verdiği kararla, adil yargılanmadığı gerekçesiyle tahliye edildi.

Mustafa Önsel evli ve 4 çocuk babasıdır.